Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmx2P43687 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmx2P43687 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmx2P43687 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmx2P43687 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms