Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfsf9P41274 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfsf9P41274 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf9P41274 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf9P41274 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms