Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PpargP37238 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PpargP37238 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpargP37238 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpargP37238 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PpargP37238 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PpargP37238 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpargP37238 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpargP37238 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PpargP37238 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PpargP37238 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpargP37238 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpargP37238 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PpargP37238 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PpargP37238 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpargP37238 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PpargP37238 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PpargP37238 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpargP37238 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PpargP37238 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PpargP37238 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PpargP37238 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PpargP37238 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PpargP37238 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpargP37238 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PpargP37238 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpargP37238 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpargP37238 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpargP37238 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PpargP37238 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PpargP37238 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms