Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddit3P35639 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddit3P35639 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddit3P35639 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms