Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apex1P28352 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apex1P28352 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apex1P28352 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apex1P28352 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apex1P28352 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apex1P28352 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apex1P28352 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apex1P28352 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Apex1P28352 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apex1P28352 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms