Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nfkb1P25799 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nfkb1P25799 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nfkb1P25799 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms