Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf8P23611 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf8P23611 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf8P23611 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf8P23611 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf8P23611 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irf8P23611 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irf8P23611 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms