Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfeP19426 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NelfeP19426 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfeP19426 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NelfeP19426 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NelfeP19426 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NelfeP19426 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NelfeP19426 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NelfeP19426 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NelfeP19426 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NelfeP19426 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NelfeP19426 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NelfeP19426 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NelfeP19426 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfeP19426 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NelfeP19426 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms