Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp53P15975 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp53P15975 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp53P15975 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp53P15975 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp53P15975 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp53P15975 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp53P15975 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp53P15975 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms