Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AppP12023 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AppP12023 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AppP12023 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AppP12023 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AppP12023 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AppP12023 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AppP12023 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AppP12023 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AppP12023 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AppP12023 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AppP12023 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AppP12023 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AppP12023 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AppP12023 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AppP12023 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AppP12023 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AppP12023 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AppP12023 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AppP12023 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AppP12023 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AppP12023 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AppP12023 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AppP12023 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AppP12023 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AppP12023 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AppP12023 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AppP12023 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AppP12023 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AppP12023 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AppP12023 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AppP12023 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AppP12023 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AppP12023 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AppP12023 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AppP12023 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AppP12023 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AppP12023 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AppP12023 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AppP12023 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AppP12023 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AppP12023 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AppP12023 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AppP12023 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AppP12023 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AppP12023 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AppP12023 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AppP12023 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AppP12023 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AppP12023 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AppP12023 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AppP12023 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AppP12023 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AppP12023 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AppP12023 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AppP12023 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AppP12023 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AppP12023 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AppP12023 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AppP12023 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AppP12023 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AppP12023 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AppP12023 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AppP12023 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AppP12023 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AppP12023 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AppP12023 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AppP12023 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AppP12023 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms