Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sub1P11031 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sub1P11031 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sub1P11031 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sub1P11031 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sub1P11031 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms