Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P10404 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P10404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P10404 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P10404 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
P10404 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P10404 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P10404 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P10404 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P10404 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P10404 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P10404 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P10404 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P10404 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P10404 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P10404 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P10404 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P10404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P10404 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P10404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P10404 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P10404 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P10404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P10404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P10404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P10404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P10404 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P10404 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P10404 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P10404 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P10404 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P10404 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P10404 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P10404 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P10404 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P10404 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P10404 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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