Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pla2g4bP0C871 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pla2g4bP0C871 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pla2g4bP0C871 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pla2g4bP0C871 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pla2g4bP0C871 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms