Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prm2P07978 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms