Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csf1P07141 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf1P07141 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csf1P07141 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf1P07141 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf1P07141 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1P07141 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf1P07141 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1P07141 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf1P07141 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf1P07141 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf1P07141 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf1P07141 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms