Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06334 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06334 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06334 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06334 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06334 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06334 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06334 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06334 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06334 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06334 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06334 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06334 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06334 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06334 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06334 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06334 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06334 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P06334 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06334 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06334 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06334 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06334 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06334 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P06334 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06334 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P06334 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06334 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06334 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P06334 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P06334 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06334 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06334 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06334 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06334 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P06334 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms