Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01783 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01783 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01783 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01783 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01783 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01783 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01783 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01783 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01783 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01783 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01783 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01783 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01783 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01783 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01783 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01783 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01783 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01783 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01783 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01783 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01783 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01783 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01783 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01783 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01783 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01783 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01783 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01783 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01783 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01783 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01783 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01783 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01783 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01783 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01783 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01783 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01783 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01783 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01783 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms