Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01747 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01747 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01747 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01747 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01747 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01747 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01747 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01747 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01747 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01747 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01747 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01747 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01747 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01747 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01747 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01747 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01747 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01747 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01747 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01747 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01747 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01747 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01747 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01747 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01747 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01747 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms