Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm6aO70546 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm6aO70546 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm6aO70546 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm6aO70546 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm6aO70546 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms