Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcn4O70507 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn4O70507 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcn4O70507 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn4O70507 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms