Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
OtogO55225 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OtogO55225 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
OtogO55225 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OtogO55225 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
OtogO55225 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OtogO55225 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OtogO55225 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OtogO55225 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
OtogO55225 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
OtogO55225 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtogO55225 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtogO55225 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtogO55225 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OtogO55225 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtogO55225 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtogO55225 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OtogO55225 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtogO55225 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtogO55225 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtogO55225 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OtogO55225 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OtogO55225 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OtogO55225 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OtogO55225 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtogO55225 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtogO55225 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtogO55225 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OtogO55225 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OtogO55225 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtogO55225 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtogO55225 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OtogO55225 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OtogO55225 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OtogO55225 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OtogO55225 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OtogO55225 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OtogO55225 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OtogO55225 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OtogO55225 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtogO55225 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
OtogO55225 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OtogO55225 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms