Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RaxO35602 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RaxO35602 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaxO35602 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaxO35602 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaxO35602 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaxO35602 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RaxO35602 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaxO35602 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaxO35602 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaxO35602 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RaxO35602 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaxO35602 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaxO35602 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaxO35602 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RaxO35602 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RaxO35602 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaxO35602 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RaxO35602 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RaxO35602 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RaxO35602 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RaxO35602 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RaxO35602 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RaxO35602 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaxO35602 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaxO35602 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RaxO35602 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaxO35602 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RaxO35602 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RaxO35602 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RaxO35602 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaxO35602 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaxO35602 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RaxO35602 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RaxO35602 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RaxO35602 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RaxO35602 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RaxO35602 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RaxO35602 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RaxO35602 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RaxO35602 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaxO35602 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RaxO35602 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaxO35602 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaxO35602 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RaxO35602 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RaxO35602 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RaxO35602 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RaxO35602 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RaxO35602 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RaxO35602 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaxO35602 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RaxO35602 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RaxO35602 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RaxO35602 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RaxO35602 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaxO35602 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaxO35602 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaxO35602 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RaxO35602 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaxO35602 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaxO35602 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RaxO35602 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms