Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1dO35473 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1dO35473 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1dO35473 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1dO35473 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1dO35473 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1dO35473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1dO35473 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1dO35473 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1dO35473 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1dO35473 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1dO35473 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1dO35473 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C1dO35473 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1dO35473 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1dO35473 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1dO35473 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1dO35473 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1dO35473 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1dO35473 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1dO35473 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1dO35473 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1dO35473 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1dO35473 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1dO35473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1dO35473 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1dO35473 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1dO35473 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1dO35473 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1dO35473 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1dO35473 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1dO35473 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1dO35473 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1dO35473 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1dO35473 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1dO35473 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1dO35473 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1dO35473 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1dO35473 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 873.4 ms