Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Slc18a3O35304 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Slc18a3O35304 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Slc18a3O35304 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Slc18a3O35304 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc18a3O35304 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Slc18a3O35304 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc18a3O35304 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Slc18a3O35304 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Slc18a3O35304 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Slc18a3O35304 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Slc18a3O35304 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc18a3O35304 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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