Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtgisO35074 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtgisO35074 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgisO35074 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgisO35074 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtgisO35074 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgisO35074 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgisO35074 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgisO35074 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgisO35074 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms