Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-M9O19442 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-M9O19442 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-M9O19442 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-M9O19442 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms