Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Aldh3b2E9Q3E1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aldh3b2E9Q3E1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.9 ms