Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930523C07RikE9Q2T4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930523C07RikE9Q2T4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930523C07RikE9Q2T4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
4930523C07RikE9Q2T4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
4930523C07RikE9Q2T4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
4930523C07RikE9Q2T4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930523C07RikE9Q2T4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4930523C07RikE9Q2T4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms