Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gimd1E9PW74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gimd1E9PW74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gimd1E9PW74 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gimd1E9PW74 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms