Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc78D3Z5T1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc78D3Z5T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc78D3Z5T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc78D3Z5T1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms