Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfbr3lD3YZZ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfbr3lD3YZZ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfbr3lD3YZZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms