Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam71aB7XG49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam71aB7XG49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam71aB7XG49 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam71aB7XG49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms