Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Skint7A7XV04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Skint7A7XV04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Skint7A7XV04 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint7A7XV04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint7A7XV04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms