Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ism1A2ATD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ism1A2ATD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ism1A2ATD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ism1A2ATD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms