Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rtf1A2AQ19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rtf1A2AQ19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rtf1A2AQ19 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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