Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GabreA2AMW3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GabreA2AMW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GabreA2AMW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GabreA2AMW3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms