Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam43bA2AM80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam43bA2AM80 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam43bA2AM80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam43bA2AM80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms