Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhbdl2A2AGA4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhbdl2A2AGA4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhbdl2A2AGA4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhbdl2A2AGA4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms