Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Prdm2A2A7B5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prdm2A2A7B5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Prdm2A2A7B5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Prdm2A2A7B5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Prdm2A2A7B5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms