Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc173A0JLY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc173A0JLY1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc173A0JLY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc173A0JLY1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc173A0JLY1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms