Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc112A0AUP1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc112A0AUP1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc112A0AUP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc112A0AUP1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms