Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
1700019A02RikA0A087WPV9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700019A02RikA0A087WPV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms