Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17190V9GX38 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms