Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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