Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt16Q9Z2K1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt16Q9Z2K1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms