Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms