Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NgfrQ9Z0W1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NgfrQ9Z0W1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms