Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scnn1bQ9WU38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scnn1bQ9WU38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms