Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkraQ9WTX2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms