Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tmed2Q9R0Q3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed2Q9R0Q3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms